Werner ha 26 anni, è nato a Merano ma risiede a San Leonardo in val Passiria. E’ tesserato per il Gruppo sportivo Fiamme Gialle, è esploso relativamente tardi soprattutto perché la sua carriera è stata costellata da diversi infortuni. Il suo esordio in Coppa del Mondo risale al 2001 sulla pista Stelvio, a Bormio. Ha ottenuto i primi risultati di un certo spessore, a livello internazionale, nella stagione 2006/2007, quando è giunto nono a Kvitfjell e dodicesimo a Lake Louise, in entrambi i casi in discesa libera. Nella stagione 2007/2008 ha continuato a crescere, tanto da piazzarsi sesto nella libera di Lake Louise  e addirittura primo davanti a Bode Miller sempre a Kvitfjell, su una pista che ha dimostrato di gradire particolarmente. Ha disputato 63 gare in Coppa Europa conquistando due podi e 63 gare in Coppa del Mondo, dove ha ottenuto 2 vittorie e 1 terzo posto. Ha scarponi, sci e attacchi Rossignol. E’ estroverso ed ha personalità da vendere, il che lo ha reso rapidamente uno degli elementi più carismatici della nazionale italiana di velocità.